تشكّل وكالة الجامعة للفروع بوادي الدواسر والسليل امتداداً لإدارة الجامعة بالخرج، وتستحوذ على ما يقارب (25%) من إجمالي كليات الجامعة. نشأت كمبادرة استراتيجية للتغلب على بعد المسافة بين كليات محافظتي وادي الدواسر والسليل وبين إدارة الجامعة، في محاولة للقضاء على معاناة طلاب ومنسوبي ومراجعي الكليات، وما يترتب على ذلك من تأخير في إنجاز المعاملات، وصعوبة في مراجعة الجامعة.
أخذت الوكالة على عاتقها ــ منذ نشأتها ــ مسؤولية التنسيق التام مع الجامعة لتقديم برامج أكاديمية تتوافق مع متطلبات البيئة المحلية، واحتياجات المناطق التي تمارس فيها الوكالة أعمالها، وتحقيق آمال الجامعة وطموحاتها لمواءمة العملية التعليمية والأكاديمية مع الرؤية الاستراتيجية للمملكة (2030).
تسعى الوكالة إلى تطوير النُظُم الإدارية والوظيفية، وتأهيل منسوبيها (أكاديميين وإداريين) لتقديم خدمات متميزة، ومتابعة تنفيذها من خلال الإشراف على إدارات الكليات والمراكز والوحدات التابعة لها، وفقًا للبرامج والخطط الخاصة بتطوير الأداء، ورفع الكفاءة الوظيفية.
ترتب وكالة الجامعة للفروع في هيكلها الإداري برئيس الجامعة مباشرة، وتمارس أعمالها الأكاديمية والإدارية بالتوافق مع الخطط والمعطيات والنظم المعمول بها في إدارة الجامعة.